Hermann Gmeiner visita per la prima volta quella che era la Cecoslovacchia nel 1967, invitato dall’associazione ceca di pediatria. Nasce presto un gruppo di amici SOS. I lavori di costruzione del Villaggi SOS di Doubì, una periferia di Carlsbad iniziano nel maggio del 1969.

Poco tempo dopo inizia la costruzione del secondo Villaggio SOS di Chvalcov, in Moravia, operativo dal 1973. Nel 1974 i Villaggi SOS diventano proprietà statale. Solo nel 1989 riniziano le attività SOS nel paese. Nel 1992 nasce la prima casa del giovane a Carlsbad, ampliata nel 2001.

Il terzo Villaggio SOS apre alla fine dell'agosto 2003 a Medlanky, vicino Brno.

Alla fine del 2004 i ragazzi della Casa dei Giovani SOS di Doubí sono stati temporaneamente accolti nel Villaggio SOS di Doubí. Il Villaggio SOS di Doubi è ora operativo anche come centro di formazione per Mamme SOS e per il personale locale.

Attualmente nella Repubblica Ceca ci sono 3 Villaggi SOS, 2 Case dei Giovani SOS e 1 Centro di Formazione del Personale.